Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms