Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Hoxc12Q8K5B8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Hoxc12Q8K5B8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Hoxc12Q8K5B8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Hoxc12Q8K5B8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Hoxc12Q8K5B8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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