Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Fcho1Q8K285 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Fcho1Q8K285 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Fcho1Q8K285 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Fcho1Q8K285 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Fcho1Q8K285 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Fcho1Q8K285 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Fcho1Q8K285 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms