Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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