Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrif1Q8CDD9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lrif1Q8CDD9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrif1Q8CDD9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms