Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Nhlrc3Q8CCH2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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