Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Samd4aQ8CBY1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms