Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp20Q8C6M1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms