Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TtpaQ8BWP5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TtpaQ8BWP5 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms