Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx17Q8BVL3 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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