Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ubash3bQ8BGG7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ubash3bQ8BGG7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ubash3bQ8BGG7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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