Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
H2-M10.4Q85ZW8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
H2-M10.4Q85ZW8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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