Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ttc28Q80XJ3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ttc28Q80XJ3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ttc28Q80XJ3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ttc28Q80XJ3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Ttc28Q80XJ3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Ttc28Q80XJ3 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Ttc28Q80XJ3 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ttc28Q80XJ3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ttc28Q80XJ3 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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