Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms