Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Clec18aQ7TSQ1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms