Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Actn1Q7TPR4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Actn1Q7TPR4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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