Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc6aQ78XR0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc6aQ78XR0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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