Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmed3Q78IS1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms