Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Arhgap20Q6IFT4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms