Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Clcn1Q64347 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms