Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trim24Q64127 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms