Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sema3cQ62181 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sema3cQ62181 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sema3cQ62181 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sema3cQ62181 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Sema3cQ62181 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sema3cQ62181 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sema3cQ62181 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms