Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rbbp4Q60972 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rbbp4Q60972 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms