Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm37886-201ENSMUST00000195349 1513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Mkrn3Q60764 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms