Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Samhd1Q60710 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms