Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Phf12Q5SPL2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms