Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rbm27Q5SFM8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rbm27Q5SFM8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms