Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rtl5Q5DTT4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rtl5Q5DTT4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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