Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp48Q3V0C5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp48Q3V0C5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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