Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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BB287469Q3UT53 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BB287469Q3UT53 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BB287469Q3UT53 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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