Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
E130208F15RikQ3UPV3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 366.5 ms