Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b2Q3UJB0 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms