Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trafd1Q3UDK1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trafd1Q3UDK1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms