Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms