Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
InipQ3TXT3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
InipQ3TXT3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms