Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctdnep1Q3TP92 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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