Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Hddc2Q3SXD3 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Hddc2Q3SXD3 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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