Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Atp2b3Q0VF55 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp2b3Q0VF55 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms