Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnma1Q08460 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms