Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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Sh3bp2Q06649 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp2Q06649 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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