Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcnb1Q03717 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms