Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxd1Q01822 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxd1Q01822 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxd1Q01822 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxd1Q01822 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxd1Q01822 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxd1Q01822 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxd1Q01822 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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