Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cacna1cQ01815 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms