Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Scn1bP97952 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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