Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nbr1P97432 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms