Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp1P97350 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pkp1P97350 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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