Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Hoxd13P70217 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Hoxd13P70217 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Hoxd13P70217 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Hoxd13P70217 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms