Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Acta1P68134 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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