Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps3P62908 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms