Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab3cP62823 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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